一:质粒简介
pCRISPR (Addgene #42875) 质粒,是大肠杆菌中CRISPR/Cas系统的crRNA表达载体,需要与pCas9(Addgene #42876)配合使用。
1. 大肠杆菌CRISPR-Cas9系统的crRNA表达载体
与pCas9(表达Cas9蛋白的质粒)共同转化大肠杆菌,构成完整的CRISPR-Cas9系统。
核心功能:靶向特定DNA序列,介导Cas9蛋白对目标位点的双链切割,实现大肠杆菌的基因组编辑、基因敲除或靶向筛选。
2. 构建靶向CRISPR阵列
质粒上的CRISPR阵列可插入自定义spacer序列,构建靶向不同基因的crRNA表达盒,用于:- 细菌基因组的定点敲除/突变
抗噬菌体防御(靶向噬菌体基因组序列,赋予细菌噬菌体抗性)
细菌基因功能研究(通过靶向抑制或敲除特定基因,研究其功能)
3. 必须与pCas9配合使用:pCRISPR仅提供crRNA,Cas9蛋白由pCas9(Addgene #42876)提供,两者共转化大肠杆菌才能发挥CRISPR切割功能。
4. 抗性筛选:使用卡那霉素筛选含pCRISPR的细菌,pCas9则用氯霉素筛选,双抗性筛选可确保两个质粒同时存在。
5. spacer插入:通过MCS的酶切位点,将设计好的靶向spacer序列插入CRISPR阵列,构建特异性crRNA。
- 图谱:

- 序列:
- CTCGAGTCCCTATCAGTGATAGAGATTGACATCCCTATCAGTGATAGAGATACTGAGCACATCAGCAGG
- ACGCACTGACCGAATTCAACTCAACAAGTCTCAGTGTGCTGAAGTTTTGGGACCATTCAAAACAGCAT
- AGCTCTAAAACGAGACCTTTGAGCTTCCGAGACTGGTCTCAGTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAG
- CTCTAAAACCTCGTAGACTATTTTTGTCTAAAAAATTTCGTAATCGCACTATTTGTCTCAGCTAGACTTCA
- GTCTTGAAAAGCCCCTGTATTACTGCATTTATTAAGAGTATTATACCATATTTTTAGTTATTAAGAAATAG
- GATCCATGAATTCAACTCAACAAGTCTCAGTGTGCTGAAGTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTC
- TAAAACGAGACCTTTGAGCTTCCGAGACTGGTCTCAGTTTTGGGACCATTCAAAACAGCATAGCTCTA
- AAACCTCGTAGACTATTTTTGTCTAAAAAATTTCGTAATCGCACTATTTGTCTCAGCTAGACTTCAGTCTT
- GAAAAGCCCCTGTATTACTGCATTTATTAAGAGTATTATACCATATTTTTAGTTATTAAGAAATAGGATCC
- CATGGTACGCGTGCTAGAGGCATCAAATAAAACGAAAGGCTCAGTCGAAAGACTGGGCCTTTCGTTTT
- ATCTGTTGTTTGTCGGTGAACGCTCTCCTGAGTAGGACAAATCCGCCGCCCTAGACCTAGGGCGTTCG
- GCTGCGGCGAGCGGTATCAGCTCACTCAAAGGCGGTAATACGGTTATCCACAGAATCAGGGGATAAC
- GCAGGAAAGAACATGTGAGCAAAAGGCCAGCAAAAGGCCAGGAACCGTAAAAAGGCCGCGTTGCT
- GGCGTTTTTCCATAGGCTCCGCCCCCCTGACGAGCATCACAAAAATCGACGCTCAAGTCAGAGGTGGC
- GAAACCCGACAGGACTATAAAGATACCAGGCGTTTCCCCCTGGAAGCTCCCTCGTGCGCTCTCCTGTT
- CCGACCCTGCCGCTTACCGGATACCTGTCCGCCTTTCTCCCTTCGGGAAGCGTGGCGCTTTCTCAATGC
- TCACGCTGTAGGTATCTCAGTTCGGTGTAGGTCGTTCGCTCCAAGCTGGGCTGTGTGCACGAACCCCC
- CGTTCAGCCCGACCGCTGCGCCTTATCCGGTAACTATCGTCTTGAGTCCAACCCGGTAAGACACGACTT
- ATCGCCACTGGCAGCAGCCACTGGTAACAGGATTAGCAGAGCGAGGTATGTAGGCGGTGCTACAGAG
- TTCTTGAAGTGGTGGCCTAACTACGGCTACACTAGAAGGACAGTATTTGGTATCTGCGCTCTGCTGAA
- GCCAGTTACCTTCGGAAAAAGAGTTGGTAGCTCTTGATCCGGCAAACAAACCACCGCTGGTAGCGGT
- GGTTTTTTTGTTTGCAAGCAGCAGATTACGCGCAGAAAAAAAGGATCTCAAGAAGATCCTTTGATCTT
- TTCTACGGGGTCTGACGCTCAGTGGAACGAAAACTCACGTTAAGGGATTTTGGTCATGACTAGTGCTT
- GGATTCTCACCAATAAAAAACGCCCGGCGGCAACCGAGCGTTCTGAACAAATCCAGATGGAGTTCTG
- AGGTCATTACTGGATCTATCAACAGGAGTCCAAGCGAGCTCTCGAACCCCAGAGTCCCGCTCAGAAGA
- ACTCGTCAAGAAGGCGATAGAAGGCGATGCGCTGCGAATCGGGAGCGGCGATACCGTAAAGCACGA
- GGAAGCGGTCAGCCCATTCGCCGCCAAGCTCTTCAGCAATATCACGGGTAGCCAACGCTATGTCCTGA
- TAGCGGTCCGCCACACCCAGCCGGCCACAGTCGATGAATCCAGAAAAGCGGCCATTTTCCACCATGAT
- ATTCGGCAAGCAGGCATCGCCATGGGTCACGACGAGATCCTCGCCGTCGGGCATGCGCGCCTTGAGC
- CTGGCGAACAGTTCGGCTGGCGCGAGCCCCTGATGCTCTTCGTCCAGATCATCCTGATCGACAAGACC
- GGCTTCCATCCGAGTACGTGCTCGCTCGATGCGATGTTTCGCTTGGTGGTCGAATGGGCAGGTAGCCG
- GATCAAGCGTATGCAGCCGCCGCATTGCATCAGCCATGATGGATACTTTCTCGGCAGGAGCAAGGTGA
- GATGACAGGAGATCCTGCCCCGGCACTTCGCCCAATAGCAGCCAGTCCCTTCCCGCTTCAGTGACAAC
- GTCGAGCACAGCTGCGCAAGGAACGCCCGTCGTGGCCAGCCACGATAGCCGCGCTGCCTCGTCCTGC
- AGTTCATTCAGGGCACCGGACAGGTCGGTCTTGACAAAAAGAACCGGGCGCCCCTGCGCTGACAGC
- CGGAACACGGCGGCATCAGAGCAGCCGATTGTCTGTTGTGCCCAGTCATAGCCGAATAGCCTCTCCAC
- CCAAGCGGCCGGAGAACCTGCGTGCAATCCATCTTGTTCAATCATGCGAAACGATCCTCATCCTGTCTC
- TTGATCAGATCTTGATCCCCTGCGCCATCAGATCCTTGGCGGCAAGAAAGCCATCCAGTTTACTTTGCA
- GGGCTTCCCAACCTTACCAGAGGGCGCCCCAGCTGGCAATTCCGACGTCTAAGAAACCATTATTATCAT
- GACATTAACCTATAAAAATAGGCGTATCACGAGGCCCTTTCGTCTTCAC